The Metagenomics and Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB) International Consortium inaugural meeting report - Analytical Genomics Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Microbiome Année : 2016

The Metagenomics and Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB) International Consortium inaugural meeting report

Ariel Chernomoretz
  • Fonction : Auteur
Gustavo Stolovitzky
  • Fonction : Auteur
Pawel P. Labaj
  • Fonction : Auteur
Alexandra B. Graf
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Aaron Darling
Catherine Burke
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Houtan Noushmehr
Milton Ozorio Moraes
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Emmanuel Dias-Neto
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Yongli Guo
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Zhi Xie
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Patrick Lee
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Leming Shi
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Carlos A. Ruiz-Perez
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Maria Mercedes Zambrano
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Amged Ouf
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Lothar H. Wieler
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Niyaz Ahmed
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Bharath Prithi-Viraj
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Narasimha Nedunuri
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Shaadi Mehr
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Kambiz Banihashemi
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Makoto Kuroda
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Riu Yamashita
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Yukoto Sato
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Eli Kaminuma
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Celia M. Alpuche Aranda
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Jesus Martinez
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Christopher Dada
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Marius Dybwad
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Manuela Oliveira
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Stephan Schuster
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Geoffrey H. Siwo
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Soojin Jang
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Sung Chul Seo
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Sung Ho Hwang
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Stephan Ossowski
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Daniela Bezdan
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Salama Chaker
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Aspassia D. Chatziefthimiou
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Klas Udekwu
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Per Liungdahl
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Ugur Sezerman
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Cem Meydan
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Eran Elhaik
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Gaston Gonnet
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Lynn M. Schriml
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Christopher E. Mason
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Jonathan Eisen
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David Hirschberg
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Mark Hernandez
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Metasub Int Consortium
  • Fonction : Auteur

Résumé

The Metagenomics and Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB) International Consortium is a novel, interdisciplinary initiative comprised of experts across many fields, including genomics, data analysis, engineering, public health, and architecture. The ultimate goal of the MetaSUB Consortium is to improve city utilization and planning through the detection, measurement, and design of metagenomics within urban environments. Although continual measures occur for temperature, air pressure, weather, and human activity, including longitudinal, cross-kingdom ecosystem dynamics can alter and improve the design of cities. The MetaSUB Consortium is aiding these efforts by developing and testing metagenomic methods and standards, including optimized methods for sample collection, DNA/RNA isolation, taxa characterization, and data visualization. The data produced by the consortium can aid city planners, public health officials, and architectural designers. In addition, the study will continue to lead to the discovery of new species, global maps of antimicrobial resistance (AMR) markers, and novel biosynthetic gene clusters (BGCs). Finally, we note that engineered metagenomic ecosystems can help enable more responsive, safer, and quantified cities.

Dates et versions

hal-01528508 , version 1 (29-05-2017)

Identifiants

Citer

Ariel Chernomoretz, Gustavo Stolovitzky, Pawel P. Labaj, Alexandra B. Graf, Aaron Darling, et al.. The Metagenomics and Metadesign of the Subways and Urban Biomes (MetaSUB) International Consortium inaugural meeting report. Microbiome, 2016, 4, pp.24. ⟨10.1186/s40168-016-0168-z⟩. ⟨hal-01528508⟩
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