Magnetic Resonance Spectroscopy Data Analysis for Clinical Applications - Archive ouverte HAL Access content directly
Theses Year : 2015

Magnetic Resonance Spectroscopy Data Analysis for Clinical Applications

Analyse des données Spectroscopie par résonance magnétique pour les applications cliniques



The aim of this thesis is to make quantitative MRS a more valuable and attractive tool for daily clinical routine use. In the first part of this thesis we will give a brief overview of clinical proton MRS, discussing some common clinical MRS problems. In the second part we will focus on developing a standard protocol to confront the accuracy of different MR scanners from different vendors, analyzing water signals with the open source software package jMRUI – v5.0. Then we will discuss some examples of T1, T2 estimation of water and metabolites at the 3T MR scanner of A.O.U. Meyer using the Siemens phantom aimed to quantitation of metabolites concentration. Some examples of quantitation coming from S.G.D. and S.M.N. hospital will be described too. In the final part some examples of in vivo prostate cancer spectroscopic data analysis will be described, illustrating the potential of MRS, the differences between Philips data analysis software and jMRUI-v5.0, and showing the problems in the daily clinical routine acquisitions too. These MRS data have been acquired at Philips Achieva 1.5 T (S.M.N. hospital). As a future development we will describe an interesting application of PMMA and gold nanoparticles to MR, using the know-how coming from biophotonics research at IFAC-CNR.
L'objectif de cette thèse est de faire MRS quantitative un outil plus utile et attrayant pour une utilisation clinique de routine quotidienne. Dans la première partie de cette thèse, nous allons donner un bref aperçu des MRS de protons cliniques, discutant des problèmes cliniques communs MRS. Dans la deuxième partie, nous allons nous concentrer sur l'élaboration d'un protocole standard pour faire face à la précision des différents scanners MR de différents fournisseurs, analyse des signaux d'eau avec le package open source de logiciels jMRUI - v5.0. Ensuite, nous allons discuter de quelques exemples de T1, T2 estimation de l'eau et des métabolites au scanner 3T MR de A.O.U. Meyer en utilisant le fantôme Siemens visant à la quantification de la concentration de métabolites. Quelques exemples de quantification provenant de S.G.D. et S.M.N. l'hôpital sera décrit aussi. Dans la dernière partie quelques exemples de la prostate spectroscopique de cancer analyse in vivo de données seront décrites, illustrant le potentiel des MRS, les différences entre Philips logiciel d'analyse de données et jMRUI-v5.0, et montrant les problèmes dans les acquisitions cliniques de routine quotidienne aussi. Ces données MRS ont été acquises chez Philips Achieva 1,5 (hôpital S.M.N.) T. En tant que développement futur, nous allons décrire une application intéressante de PMMA et de nanoparticules d'or à MR, en utilisant le savoir-faire provenant de la recherche en biophotonique au IFAC-CNR.
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Dates and versions

tel-01389254 , version 1 (11-11-2016)


  • HAL Id : tel-01389254 , version 1


Barucci Andrea. Magnetic Resonance Spectroscopy Data Analysis for Clinical Applications . Medical Physics []. Università degli studi di Firenze, 2015. English. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-01389254⟩
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