Évaluation des facteurs de risques de bio contamination par Salmonella et Escherichia coli virulents de la chaîne alimentaire des légumes à Abidjan (Côte d’Ivoire) - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2018

Assessment of risk factors bio contamination by Salmonella and Escherichia virulent coli of the food chain of vegetables in Abidjan (Ivory Coast)

Évaluation des facteurs de risques de bio contamination par Salmonella et Escherichia coli virulents de la chaîne alimentaire des légumes à Abidjan (Côte d’Ivoire)

Résumé

The objective of this study was to contrubute to minimize the risk of intoxication linked to the consumption of ready-to-eat raw mixed vegetables salads in collective catering, by assessing the factors of bio-contamination of the food chain by Salmonella and virulent Escherichia coli. A survey was conducted among 330 producers and sellers and 500 consumers. A total of 552 samples of vegetables salads and ready-to-eat raw mixed vegetables salads were subjected to microbiological analysis which consisted of isolation and identification of Escherichia coli and Salmonella. A confirmation of the identification was carried out by detecting iudA and RNA 16S genes. Virulence genes have been detected in E. coli and Salmonella strains were serotyped. Antimicrobial resistance profiles and supports were determined for all Salmonella strains and E. coli with virulence factors. The probability of consuming salads contaminated with these germs has been estimated and risk management measures have been proposed. The consumption rate of ready-to-eat raw mixed vegetables salads in collective catering was 38.6%. The microbiological quality of the food was unsatisfactory for 42.7% of vegetables salads and 61.7% of ready-to-eat raw mixed vegetable salads. The diversity and prevalence of pathovars detected respectively in vegetables and ready-to-eat raw mixed vegetable salads were ETEC (17.1% and 35.3%), EAEC (12.2% and 20.6%), EPEC (2.0% and 7.5%) and STEC (1.6% and 4.9%). The prevalence of Salmonella in vegetables salads and ready-to-eat vegetable salads was 8.5% and 2.6%. The prevalence of virulent E. coli and Salmonella resistant to antibiotics was 11.3% and 15.4% and 6.9% and 1.0% respectively. Antibiotic resistance concerned tetracycline widely (from 40 to 62.5%) and streptomycin (22 to 57.1%). The genes aaa[3]-IV, CIMT QnrA, tetA, tetB, cmlA and cat1 respectively conferring resistance to gentamicin, ampicillin, quinolones, tetracycline and chloramphenicol were highlighted. The probability of consuming salads contaminated with Salmonella spp. and E. coli virulent was 1% and de13.6% respectively. Study reveals risk of consuming salads contaminated with virulent and multi-resistant Salmonella and E. coli. The implementation of health control measures proposed in the study, would reduce the risk of contamination.
Thèse unique de Doctorat xxix L’objectif de cette étude est de contribuer à minimiser le risque d’intoxication lié à la consommation des salades de légumes servies en restauration collective à Abidjan, en évaluant les facteurs de risque de biocontamination de la chaîne alimentaire par Salmonella et Escherichia coli virulents. Une enquête a été effectuée auprès de 330 producteurs et vendeurs et 500 consommateurs. Un total de 552 échantillons de légumes et salades de légume a été l’objet d’analyse microbiologique qui a consisté en un isolement et une identification de Escherichia coli et de Salmonella. La confirmation de l’identification a été effectuée par la détection des gènes iudA et RNA 16S. Les gènes de virulence ont été détectés chez E. coli et les souches de Salmonella ont été sérotypées. Les profils et supports d’antibiorésistance ont été déterminés pour l’ensemble des souches de Salmonella et de E. coli présentant des facteurs de virulence. La probabilité de consommer des salades contaminées par ces germes a été estimée et des mesures de maîtrise sanitaires du risque ont été proposées. Le taux de consommation des salades en restauration collective était de 38,6%. La qualité microbiologique des denrées était non satisfaisante pour 42,7% des légumes et 61,7% des salades de légume. La diversité et la prévalence des pathovars détectées respectivement dans les légumes et salades de légume étaient ETEC (17,1% et 35,3%), EAEC (12,2% et 20,6%), EPEC (2,0% et 7,5%) et STEC (1,6% et 4,9%). La prévalence de Salmonella dans les légumes et salades de légumes était de 8,5% et 2,6%. La prévalence de E. coli virulents et Salmonella résistants aux antibiotiques était respectivement de 11,3% et 15,4% et de 6,9% et 1,0%. L’antibiorésistance concernait plus largement la tétracycline (40-62,5%) et la streptomycine (22-57,1%). Les gènes aaa [3]-IV, CIMT, QnrA, tetA, tetB, cmlA et cat1 conférant respectivement la résistance à la gentamicine, à l’ampicilline, aux quinolones, à la tétracycline et au chloramphénicol ont été mis en évidence. La probabilité de consommer des salades contaminées par Salmonella spp. et E. coli virulents était respectivement de 1% et de 13,6%. L’étude montre un risque de consommer des salades contaminées par des Salmonella et E. coli virulents et multi résistants aux antibiotiques. La mise en oeuvre des mesures de maîtrise sanitaire proposées dans l’étude, permettrait de réduire le risque de contamination.
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Citer

Evelyne Toe. Évaluation des facteurs de risques de bio contamination par Salmonella et Escherichia coli virulents de la chaîne alimentaire des légumes à Abidjan (Côte d’Ivoire). Ingénierie des aliments. Université Nangui Abrogoua (Côte d'Ivoire), 2018. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-02099115⟩
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