Développement et évaluation de tests antigéniques rapides pour le diagnostic d’infections méningococciques et pneumococciques - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2019

Development and evaluation of rapid antigenic tests for the diagnosis of meningococcal and pneumococcal infections

Développement et évaluation de tests antigéniques rapides pour le diagnostic d’infections méningococciques et pneumococciques

Résumé

Nowadays, Rapid Diagnostic Tests (RDTs) are essential tools for an urgent response in infectious diseases. Many tests are available to search for different pathogens (HIV, group A streptococcus, plasmodium ...) in various biological samples (urine, cerebrospinal fluid or CSF, blood ...). The main advantages of this mode of diagnosis are speed, simplicity of implementation, including by non-specialists or outside a laboratory structure, and reasonable cost. In this “CIFRE” (industrial) thesis, we present three RDTs based on lateral flow immunochromatography (LFIA) that we contributed to develop and evaluate.The first TDR targets Neisseria meningitidis, a bacterium responsible for severe outbreaks of meningitis in resource-limited countries, in CSF samples. This RDT is the only LFIA-type commercial test that can detect 5 of the 6 major serogroups involved in the disease (A/C/W/X/Y). A study published under the authority of the meningococci reference centre at the Institut Pasteur of Paris showed the excellent performances of this test on nearly 560 CSF samples collected from 6 countries including 5 in Africa.The second TDR targets Streptococcus pneumoniae in urine and CSF; it is also intended to the diagnosis of bacterial meningitis. This test, coupled with the previous one, is the object of a multicentric study presently conducted in West Africa under cover of WHO.The third TDR is an avatar of the previous one but was dedicated to respiratory secretions. Called PneumoResp, it introduces the concept of semi-quantitative RDT. It proposes to perform the test on undiluted secretions and, in the case of positive result, on 1:100-diluted secretions. We present an algorithm (which is the object of a patent pending appraisal) that aims to differentiate S. pneumoniae carriage from invasive infection by this germ in children. Compared to conventional techniques (semi-quantitative culture and qPCR assays), the test performed on 196 respiratory specimens showed an excellent sensitivity and a very good negative predictive value, allowing to exclude or suspect an active S. pneumoniae infection as soon as the first day.
Les tests de diagnostic rapide (TDR) sont aujourd’hui des outils indispensables pour une réponse urgente en pathologie infectieuse. De nombreux tests sont disponibles pour rechercher différents agents pathogènes (VIH, streptocoque du groupe A, plasmodium …) dans des prélèvements biologiques variés (urine, liquide cérébrospinal ou LCS, sang …). L’avantage de ce mode de diagnostic est leur rapidité, leur simplicité de mise en œuvre, y compris par des non-spécialistes ou à l’extérieur d’une structure de laboratoire, et leur coût raisonnable. Dans ce travail de thèse CIFRE, nous présentons trois TDR que nous avons contribué à développer et à évaluer, basés sur l’immunochromatographie à flux latéral (LFIA). Le premier TDR cible Neisseria meningitidis dans le LCS, bactérie responsable de redoutables épidémies de méningites dans les pays à ressources limitées. Ce TDR est le seul test commercial de type LFIA qui permette de détecter 5 des 6 principaux sérogroupes impliqués dans la maladie (A/C/W/X/Y). Une étude publiée sous l’égide du CNR des méningocoques à l’Institut Pasteur de Paris montre les excellentes performances de ce test sur près de 560 échantillons de LCS provenant de 6 pays. Le deuxième TDR cible Streptococcus pneumoniae dans l’urine et le LCS, également dans le cadre du diagnostic des méningites bactériennes. Ce test, couplé au précédent, fait l’objet d’une étude multicentrique en Afrique de l’ouest sous couvert de l’OMS. Le troisième TDR est un avatar du précédent dédié aux sécrétions respiratoires. Dénommé PneumoResp, il introduit le concept de TDR semi-quantitatif en proposant d’effectuer le test sur sécrétions non diluées et, en cas de résultat positif, sur sécrétions diluées au 1 :100ème. Nous proposons un algorithme (qui fait l’objet d’un brevet en cours d’expertise) qui vise à différencier le portage de l’infection invasive à S. pneumoniae chez l’enfant. Par rapport aux techniques conventionnelles (culture semi-quantitative et qPCR), nous montrons sur quelque 200 échantillons respiratoires une excellente sensibilité et une très bonne valeur prédictive négative de ce test pour exclure ou suspecter une infection active à S. pneumoniae chez l’enfant dès le premier jour.
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Dates et versions

tel-02896584 , version 1 (10-07-2020)

Identifiants

  • HAL Id : tel-02896584 , version 1

Citer

Cyrille Hedi Haddar. Développement et évaluation de tests antigéniques rapides pour le diagnostic d’infections méningococciques et pneumococciques. Médecine humaine et pathologie. Université de Lyon, 2019. Français. ⟨NNT : 2019LYSES065⟩. ⟨tel-02896584⟩
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