Identification de marqueurs membranaires spécifiques de cellules progénitrices cardiaques PW1+ par une approche multiomique - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2018

Multiomics characterization of PW1+ cardiac progenitor cells specific membrane associated markers

Identification de marqueurs membranaires spécifiques de cellules progénitrices cardiaques PW1+ par une approche multiomique

Résumé

Ischemic heart diseases are the major cause of heart faillure, one of the most concerning disease in the world. The scarring process following myocardial infarction has been shown to be driven by cardiac progenitors celles (CPC), and PW1+ CPCs were shown to mediate and participate to this process. To target PW1+ cells, we are limited to a PW1nLacZ reporter mice model. We aim to find a membrane bound protein associated with PW1 presence to help to target specifically those cells. Using a prediction software suite, we predicted a specific membranome for PW1+ CPCs from RNA-Seq datas. We performed a mass spectrometry analysis to determine an observed membranome, and the combination of both approaches allowed us to find candidates to test. We then confirmed the expression of the candidates, and one showed strong sensibility and sensibility to describe PW1+ cells. The inhibition of this target by pharmacological drug in vitro and in vivo showed a significant decrease of fibrosis in a myocardial infarction murine model together with a significant increase of survival after treatment.
Les cardiopathies ischémiques sont la cause principale d'insuffisance cardiaque. Lors du processus de cicatrisation suite à un infarctus, il a été montré que les cellules souches progénitrices cardiaques PW1+ participaient activement au remodelage du cœur, et ce, en en participant à l'augmentation du nombre de fibroblastes. A l'heure actuelle les cellules PW1+ ne peuvent être récoltées qu'à travers l'utilisation d'une lignée rapportrice exprimant la B-Galactosidase sous le contrôle du gène Pw1. Ce projet a pour but de déterminer un marqueur membranaire associé à la présence de PW1 permettant de cibler spécifiquement ces cellules. A l'aide d'une suite logicielle, nous avons pu prédire un membranome des cellules PW1+ à partir de données RNA-seq que nous avons croisé avec le membranome observé par spectrométrie de masse. Cette approche combinée nous a permis de déterminer un ensemble de cibles d'intérêt dont l'expression a ensuite été validée par cytométrie en flux. Nous avons été capables d'associer la présence d’une protéine membranaire avec la présence de PW1 dans la fraction non myocytaire avec une forte spécificité et sensibilité. Des inhibiteurs pharmacologiques ont été décrit pour cette protéine, et leur utilisation in vitro puis in vivo a permis de montrer une réduction significative de la fibrose dans un modèle murin d'infarctus du myocarde accompagnée d'une augmentation de la survie après traitement.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-02922319 , version 1 (26-08-2020)

Identifiants

  • HAL Id : tel-02922319 , version 1

Citer

Olivier Claude. Identification de marqueurs membranaires spécifiques de cellules progénitrices cardiaques PW1+ par une approche multiomique. Cardiologie et système cardiovasculaire. Sorbonne Université, 2018. Français. ⟨NNT : 2018SORUS116⟩. ⟨tel-02922319⟩
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