Émergence et dynamique de diffusion des entérobactéries résistantes aux antibiotiques dans les DOM du Sud-Ouest de l’Océan Indien dans une approche One Health - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2021

Emergence and dynamics of the spread of antimicrobial-resistant enterobacteria in the French Overseas Territories of indian ocean from a One Health approach

Émergence et dynamique de diffusion des entérobactéries résistantes aux antibiotiques dans les DOM du Sud-Ouest de l’Océan Indien dans une approche One Health

Résumé

The biogeographical and sanitary particularities of the South-West Indian Ocean islands represent both a challenge for the implementation of public health policies and a context favourable to the study of emergences and dissemination such as that of Multidrug-Resistant Bacteria (MDRB) or Extensively-drug Resistant Bacteria (XDRB). On Reunion Island, strains of Extended Spectrum Beta-Lactamase (ESBL) or Carbapenemase (CPE) producing Enterobacteriaceae are screened and monitored in the hospital. However, at the beginning of this work, no data existed on the spread of these enterobacteria in the community, as well as the possible interactions between the environmental, animal and human compartments. Moreover, the commercial exchanges and the important movements of populations between Reunion and the other islands of the Indian Ocean (and in particular Mayotte), where this phenomenon of antibiotic resistance seems to be even more developed, expose the island to imports of these bacteria. In order to better understand the emergence and diffusion dynamics of multidrug- or extensively-drug- resistant bacteria, we carried out a One Health Human-Animal-Environment study to evaluate the exchanges of ESBL-producing Escherichia coli strains between these different compartments. We thus determined that livestock were not a preponderant reservoir of transmission of ESBL-producing E. coli for humans on Reunion Island, and that the majority of these transmissions was most probably due to inter-human exchanges. We also carried out an assessment of CPEs by describing the modalities of importation of these XDRB on the Reunion territory. Finally, we described some emergencies such as an outbreak of E. cloacae IMI-1 on Mayotte Island which subsequently spread to Reunion Island. Our results show that Reunion is a French overseas department where the prevalence of CPEs is high, notably due to strong import pressure. In order to limit this phenomenon, it is therefore necessary to establish a coordinated regional policy to combat antimicrobial resistance in this geographical area of the South-West Indian Ocean.
Les particularités biogéographiques et sanitaires des îles du Sud-Ouest l'Océan Indien représentent à la fois un défi pour la mise en place de politiques de Santé Publique et un contexte favorable à l'étude des émergences et diffusions comme celle des Bactéries Multi-Résistantes (BMR) ou des Bactéries Hautement Résistantes (BHR). À La Réunion, les souches d’Entérobactéries productrices de Bêta-Lactamase à Spectre Étendu (EBLSE) ou de Carbapénèmase (EPC) sont dépistées et surveillées dans le milieu hospitalier. Cependant, au début de ce travail, aucune donnée n’existait sur la diffusion de ces entérobactéries dans le milieu communautaire, ainsi que les interactions possibles entre les sphères environnementale, animale et humaine. De plus, les échanges commerciaux et les mouvements de populations importants entre La Réunion et les autres îles de l’Océan Indien (et notamment Mayotte), où ce phénomène d’antibiorésistance semble encore plus développé, expose l’île à des importations de ces bactéries. Pour mieux appréhender l’émergence et la dynamique de diffusion des bactéries multi- ou hautement-résistantes, nous avons réalisé une étude One Health Homme-animal environnement pour évaluer les échanges des souches de Escherichia coli productrices de BLSE entre ces différents compartiments. Nous avons ainsi déterminé que les animaux de rente n’étaient pas un réservoir de transmission prépondérant de E. coli BLSE pour l’Homme à La Réunion, et que l’essentiel de ces transmissions était très probablement issu d’échanges inter-humains. Nous avons également réalisé un bilan des EPC en décrivant les modalités d’importation de ces BHR sur le territoire réunionnais. Nous avons enfin décrit certaines émergences comme une épidémie de E. cloacae IMI-1 à Mayotte qui s’est secondairement étendue à La Réunion. Nos résultats démontrent que le territoire réunionnais est un DOM où la prévalence des EPC est importante, notamment en raison d’une forte pression d’importation. Pour limiter ce phénomène, il est ainsi nécessaire d’établir une politique régionale coordonnée de lutte contre l’antibiorésistance dans cette zone géographique du Sud-Ouest de l’Océan Indien.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-03688288 , version 1 (04-06-2022)

Identifiants

  • HAL Id : tel-03688288 , version 1

Citer

Guillaume Miltgen. Émergence et dynamique de diffusion des entérobactéries résistantes aux antibiotiques dans les DOM du Sud-Ouest de l’Océan Indien dans une approche One Health. Microbiologie et Parasitologie. Université de la Réunion, 2021. Français. ⟨NNT : 2021LARE0009⟩. ⟨tel-03688288⟩
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