Cette thèse propose une approche de la collaboration homme-machine, inspirée de la théorie de l'Enaction, dans le domaine de l'interprétation de données complexes. L'autonomie des deux partenaires vise à leur permettre de réaliser une interprétation en s'appuyant sur leurs compétences. Pour préserver leur autonomie, la communication du système avec son partenaire est réalisée au moyen d'annotations. Cette approche est appliquée à la conception d'un système multi-agents pour l'interprétation collaborative de signaux physiologiques de patients en réanimation médicale, i.e. des séries temporelles multivariées. Ce système est capable de construire une interprétation des séries temporelles par la construction (1) de modèles d'évènements et de scénarios (ensembles d'évènements reliés par des relations temporelles) et (2) d'annotations à partir de ces modèles. Les modèles qu'il construit évoluent au cours de l'interprétation pour prendre en compte les annotations du partenaire humain.