<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<TEI xmlns="http://www.tei-c.org/ns/1.0" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:hal="http://hal.archives-ouvertes.fr/" xmlns:gml="http://www.opengis.net/gml/3.3/" xmlns:gmlce="http://www.opengis.net/gml/3.3/ce" version="1.1" xsi:schemaLocation="http://www.tei-c.org/ns/1.0 http://api.archives-ouvertes.fr/documents/aofr-sword.xsd">
  <teiHeader>
    <fileDesc>
      <titleStmt>
        <title>HAL TEI export of tel-00371212</title>
      </titleStmt>
      <publicationStmt>
        <distributor>CCSD</distributor>
        <availability status="restricted">
          <licence target="https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/">CC0 1.0 - Universal</licence>
        </availability>
        <date when="2026-05-11T12:46:02+02:00"/>
      </publicationStmt>
      <sourceDesc>
        <p part="N">HAL API Platform</p>
      </sourceDesc>
    </fileDesc>
  </teiHeader>
  <text>
    <body>
      <listBibl>
        <biblFull>
          <titleStmt>
            <title xml:lang="en">Improved Techniques for the Generation of 3D Finite Element Meshes of Human Anatomical Structures</title>
            <title xml:lang="fr">Amélioration des Techniques de Génération de maillages 3D des structures anatomiques humaines pour la Méthode des Éléments Finis</title>
            <author role="aut">
              <persName>
                <forename type="first">Claudio</forename>
                <surname>Lobos</surname>
              </persName>
              <email type="md5">975068ffeedc822f0fbe6e4788a91459</email>
              <email type="domain">dcc.uchile.cl</email>
              <idno type="idhal" notation="numeric">952990</idno>
              <idno type="halauthorid" notation="string">225873-952990</idno>
              <affiliation ref="#struct-388249"/>
            </author>
            <editor role="depositor">
              <persName>
                <forename>Claudio</forename>
                <surname>Lobos</surname>
              </persName>
              <email type="md5">975068ffeedc822f0fbe6e4788a91459</email>
              <email type="domain">dcc.uchile.cl</email>
            </editor>
          </titleStmt>
          <editionStmt>
            <edition n="v1" type="current">
              <date type="whenSubmitted">2009-03-26 22:28:54</date>
              <date type="whenModified">2025-09-27 19:54:37</date>
              <date type="whenReleased">2009-03-27 08:43:43</date>
              <date type="whenProduced">2009-03-05</date>
              <date type="whenEndEmbargoed">2009-03-26</date>
              <ref type="file" target="https://theses.hal.science/tel-00371212v1/document">
                <date notBefore="2009-03-26"/>
              </ref>
              <ref type="file" n="1" target="https://theses.hal.science/tel-00371212v1/file/all.pdf" id="file-371212-1059514">
                <date notBefore="2009-03-26"/>
              </ref>
            </edition>
            <respStmt>
              <resp>contributor</resp>
              <name key="139451">
                <persName>
                  <forename>Claudio</forename>
                  <surname>Lobos</surname>
                </persName>
                <email type="md5">975068ffeedc822f0fbe6e4788a91459</email>
                <email type="domain">dcc.uchile.cl</email>
              </name>
            </respStmt>
          </editionStmt>
          <publicationStmt>
            <distributor>CCSD</distributor>
            <idno type="halId">tel-00371212</idno>
            <idno type="halUri">https://theses.hal.science/tel-00371212</idno>
            <idno type="halBibtex">lobos:tel-00371212</idno>
            <idno type="halRefHtml">Modeling and Simulation. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2009. English. &lt;a target="_blank" href="https://www.theses.fr/"&gt;&amp;#x27E8;NNT : &amp;#x27E9;&lt;/a&gt;</idno>
            <idno type="halRef">Modeling and Simulation. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2009. English. &amp;#x27E8;NNT : &amp;#x27E9;</idno>
            <availability status="restricted">
              <licence target="https://about.hal.science/hal-authorisation-v1/">HAL Authorization<ref corresp="#file-371212-1059514"/></licence>
            </availability>
          </publicationStmt>
          <seriesStmt>
            <idno type="stamp" n="UGA">HAL Grenoble Alpes</idno>
            <idno type="stamp" n="IMAG">IMAG</idno>
            <idno type="stamp" n="CNRS">CNRS - Centre national de la recherche scientifique</idno>
            <idno type="stamp" n="UNIV-GRENOBLE1">Université Joseph Fourier - Grenoble I</idno>
            <idno type="stamp" n="INPG">Institut polytechnique de Grenoble</idno>
            <idno type="stamp" n="UJF">Thèses de l'Université Joseph Fourier</idno>
            <idno type="stamp" n="TIMC-IMAG">TIMC</idno>
            <idno type="stamp" n="TIMC-IMAG-GMCAO" corresp="TIMC-IMAG">GMCAO : Geste Médico-Chirurgicaux Assistés par Ordinateur</idno>
            <idno type="stamp" n="TDS-MACS">Réseau de recherche en Théorie des Systèmes Distribués, Modélisation, Analyse et Contrôle des Systèmes</idno>
            <idno type="stamp" n="UNIV-LYON">Université de Lyon</idno>
            <idno type="stamp" n="UGA-EPE">Université Grenoble Alpes [2020-*]</idno>
            <idno type="stamp" n="UGA-SPAO-TEST">Thèses de l'Université Grenoble Alpes</idno>
            <idno type="stamp" n="TEST-UGA">TEST-UGA</idno>
          </seriesStmt>
          <notesStmt/>
          <sourceDesc>
            <biblStruct>
              <analytic>
                <title xml:lang="en">Improved Techniques for the Generation of 3D Finite Element Meshes of Human Anatomical Structures</title>
                <title xml:lang="fr">Amélioration des Techniques de Génération de maillages 3D des structures anatomiques humaines pour la Méthode des Éléments Finis</title>
                <author role="aut">
                  <persName>
                    <forename type="first">Claudio</forename>
                    <surname>Lobos</surname>
                  </persName>
                  <email type="md5">975068ffeedc822f0fbe6e4788a91459</email>
                  <email type="domain">dcc.uchile.cl</email>
                  <idno type="idhal" notation="numeric">952990</idno>
                  <idno type="halauthorid" notation="string">225873-952990</idno>
                  <affiliation ref="#struct-388249"/>
                </author>
              </analytic>
              <monogr>
                <imprint>
                  <date type="dateDefended">2009-03-05</date>
                </imprint>
                <authority type="institution">Université Joseph-Fourier - Grenoble I</authority>
                <authority type="school">Ingénieries pour la Santé, la Cognition et l'Environnement</authority>
                <authority type="supervisor">Yohan Payan(yohan.payan@imag.fr)</authority>
                <authority type="jury">J. TROCCAZ (Présidente)</authority>
                <authority type="jury">P. FREY (Rapporteur)</authority>
                <authority type="jury">S. COTIN (Rapporteur)</authority>
                <authority type="jury">Y. PAYAN (Co-directeur)</authority>
                <authority type="jury">N. HITSCHFELD (Co-directeur)</authority>
                <authority type="jury">F. JAILLET (Examinateur)</authority>
              </monogr>
            </biblStruct>
          </sourceDesc>
          <profileDesc>
            <langUsage>
              <language ident="en">English</language>
            </langUsage>
            <textClass>
              <keywords scheme="author">
                <term xml:lang="en">Finite Element Model</term>
                <term xml:lang="en">3D mesh generation</term>
                <term xml:lang="en">3D mesh reparation</term>
                <term xml:lang="en">human anatomical structures modelling.</term>
                <term xml:lang="fr">modélisation biomechanique des structures anatomiques humaines</term>
                <term xml:lang="fr">Éléments Finis</term>
                <term xml:lang="fr">génération des maillages 3D</term>
                <term xml:lang="fr">réparation des maillages 3D</term>
                <term xml:lang="fr">modélisation biomechanique des structures anatomiques humaines.</term>
              </keywords>
              <classCode scheme="halDomain" n="info.info-mo">Computer Science [cs]/Modeling and Simulation</classCode>
              <classCode scheme="halTypology" n="THESE">Theses</classCode>
              <classCode scheme="halOldTypology" n="THESE">Theses</classCode>
              <classCode scheme="halTreeTypology" n="THESE">Theses</classCode>
            </textClass>
            <abstract xml:lang="en">
              <p>The Finite Element Method (FEM) is probably the most used strategy to simulate physical phenomena in a domain. The method needs a subdivision of the domain into simpler geometrical structures. This subdivision is known as a mesh. The numerical solution computed by the FEM directly depends on the employed&lt;br /&gt;mesh.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;In the medical field, the domains to simulate are complex geometries. Due to this complexity, it is preferred to use Registration Methods (RMs) to produce the mesh of the domain to be simulated. The RMs are a family of strategies that "adapt" a predefined mesh (the atlas) to patient data in order to represent the target domain. A RM reallocates the nodes of the atlas without changing the topology of it. Unfortunately, the RMs don't consider element information; therefore it is possible to produce invalid and poor quality elements. This thesis proposes reparation methods to achieve validity and improve the quality of the elements in the mesh after registration. Results are presented for femur and face model.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;The most important limitation of RMs is that sometimes the focus of the simulation is given on a particular region. An example of this is the brain tumor resection surgery. In this case, a mesh with higher density of nodes is needed on the region between the opening skull point and the location of the tumor. It is on this region where the simulation must be more precise. Unfortunately an "atlas" mesh cannot be produced for each single case. Therefore a mesh generation technique with region refinement is also proposed on this thesis. Results are shown over neurosurgery.</p>
            </abstract>
            <abstract xml:lang="fr">
              <p>La Méthode des Éléments Finis (MEF) est probablement la technique la plus utilisée pour la modélisation du comportement mécanique des solides. Elle s'appuie pour cela sur une discrétisations du domaine modélisé en éléments géométrique simples. Cette partition porte le nom de maillage. La solution&lt;br /&gt;numérique calculée par la MEF dépend directement du maillage utilisé. &lt;br /&gt;&lt;br /&gt;Dans le domaine médical, les solides modélisés sont de géométrie complexe. De ce fait, nous privilégions une génération de maillage par recalage élastique. Cette méthode permet d'adapter un maillage prédéfini (atlas) aux données du patient afin de représenter le domaine à modéliser. Le recalage élastique applique un déplacement aux sommets de l'atlas sans en changer sa topologie. Les méthodes de recalage élastique ne prennent cependant pas en considération les éléments, par conséquent il est possible de produire des éléments invalides et de mauvaise qualité. Cette thèse présente une méthode de réparation des éléments après application d'un recalage élastique.&lt;br /&gt;&lt;br /&gt;Les méthodes de recalage élastique peuvent être limitées lorsque, pour une région spécifique du domaine modélisé, une discrétisation plus fine est requise alors qu'elle ne figure pas dans le maillage atlas. Par exemple dans le domaine de la neurochirurgie, un maillage d'une densité plus importante peut être nécessaire dans la région de la voie d'abord, entre la craniotomie et la tumeur car dans cette région d'intérêt une précision accrue de la simulation est requise. Nous proposons dans cette thèse une méthode de génération de maillage comportant un raffinement local. Cette méthode est appliquée à la neurochirurgie.</p>
            </abstract>
          </profileDesc>
        </biblFull>
      </listBibl>
    </body>
    <back>
      <listOrg type="structures">
        <org type="researchteam" xml:id="struct-388249" status="OLD">
          <orgName>Gestes Medico-chirurgicaux Assistés par Ordinateur</orgName>
          <orgName type="acronym">TIMC-IMAG-GMCAO</orgName>
          <date type="end">2015-12-31</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>Domaine de la Merci, 38706 La Tronche, France</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">https://www-timc.imag.fr/gmcao</ref>
          </desc>
          <listRelation>
            <relation active="#struct-707" type="direct"/>
            <relation active="#struct-51016" type="indirect"/>
            <relation active="#struct-89889" type="indirect"/>
            <relation active="#struct-301767" type="indirect"/>
            <relation name="UMR5525" active="#struct-441569" type="indirect"/>
          </listRelation>
        </org>
        <org type="laboratory" xml:id="struct-707" status="OLD">
          <idno type="IdRef">14728936X</idno>
          <idno type="ISNI">0000 0004 4687 1979</idno>
          <idno type="RNSR">199511969L</idno>
          <idno type="ROR">https://ror.org/03985kf35</idno>
          <orgName>Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525</orgName>
          <orgName type="acronym">TIMC-IMAG</orgName>
          <date type="start">1993-01-01</date>
          <date type="end">2015-12-31</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>Domaine de la Merci, 38706 La Tronche, France</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">https://www-timc.imag.fr</ref>
          </desc>
          <listRelation>
            <relation active="#struct-51016" type="direct"/>
            <relation active="#struct-89889" type="direct"/>
            <relation active="#struct-301767" type="direct"/>
            <relation name="UMR5525" active="#struct-441569" type="direct"/>
          </listRelation>
        </org>
        <org type="institution" xml:id="struct-51016" status="OLD">
          <idno type="IdRef">026404796</idno>
          <idno type="ROR">https://ror.org/02aj0kh94</idno>
          <orgName>Université Joseph Fourier - Grenoble 1</orgName>
          <orgName type="acronym">UJF</orgName>
          <date type="end">2015-12-31</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>BP 53 - 38041 Grenoble Cedex 9</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">http://www.ujf-grenoble.fr/</ref>
          </desc>
        </org>
        <org type="institution" xml:id="struct-89889" status="OLD">
          <idno type="IdRef">026388804</idno>
          <idno type="ROR">https://ror.org/05sbt2524</idno>
          <orgName>Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology</orgName>
          <orgName type="acronym">Grenoble INP</orgName>
          <date type="start">2007-01-01</date>
          <date type="end">2019-12-31</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>46 avenue Félix Viallet 38031 Grenoble Cedex 1</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">http://www.grenoble-inp.fr/</ref>
          </desc>
        </org>
        <org type="institution" xml:id="struct-301767" status="VALID">
          <idno type="ROR">https://ror.org/01c7wz417</idno>
          <orgName>VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement</orgName>
          <orgName type="acronym">VAS</orgName>
          <date type="start">2010-01-01</date>
          <desc>
            <address>
              <addrLine>Université de Lyon, VetAgro Sup, 69280 Marcy l'Etoile (campus vétérinaire); Université de Clermont, VetAgro Sup, 63370 Lempdes (campus agronomique)</addrLine>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">http://www.vetagro-sup.fr/</ref>
          </desc>
        </org>
        <org type="regroupinstitution" xml:id="struct-441569" status="VALID">
          <idno type="IdRef">02636817X</idno>
          <idno type="ISNI">0000000122597504</idno>
          <idno type="ROR">https://ror.org/02feahw73</idno>
          <orgName>Centre National de la Recherche Scientifique</orgName>
          <orgName type="acronym">CNRS</orgName>
          <date type="start">1939-10-19</date>
          <desc>
            <address>
              <country key="FR"/>
            </address>
            <ref type="url">https://www.cnrs.fr/</ref>
          </desc>
        </org>
      </listOrg>
    </back>
  </text>
</TEI>