Approches innovantes en RMN biomoléculaire: Cinétiques moléculaires par RMN rapide et paroi bactérienne par RMN du solide - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2009

Tackling challenging systems by biomolecular NMR spectroscopy: Molecular kinetics by fast NMR and bacterial cell wall by solid-state NMR

Approches innovantes en RMN biomoléculaire: Cinétiques moléculaires par RMN rapide et paroi bactérienne par RMN du solide

Résumé

Standard multidimensional NMR methods required to yield sufficient atom- resolution are time-consuming rendering real-time analysis difficult. The first part of this thesis treats recent advances in the field of fast NMR. The first part of this thesis is concerned with the optimization and extension of longitudinal relaxation enhanced pulse sequences in the context of SOFAST and BEST type experiments. The second part of this thesis deals with the bacterial cell wall of Gram-negative and Gram-positive bacteria. Because of its size and non cristalline character we applied solid state NMR to study it. The high-quality solid-state NMR spectra allow atom-resolved investigation of structure and dynamics of the peptidoglycan and its covalentely bound teichoic acids (WTA). The determination of dynamical properties of the peptidoglycan can also be used to study peptidoglycan-protein interactions and complexation with divalent ions.
Les méthodes RMN multidimensionnelles requises pour l'obtention d'une résolution atomique élevée sont relativement couteuses en temps expéri- mental, ce qui complique considérablement leur application à l'analyse d'échantillons en temps réel. La première partie de cette thèse traite des pro- grès récents dans le domaine de l'acquisition rapide des spectres de RMN . La deuxième partie concerne la paroi cellulaire des bactéries Gram-négatives et Gram-positives. En raison de son poids moléculaire élevé et de son car- actère non cristallin, nous avons appliqué la RMN du solide pour l'étudier. La qualité exceptionnelle des spectres de RMN solide permet l'étude, à résolution atomique, de la structure et de la dynamique du peptidoglycane et des acides téchoïques qui se lient de manière covalente au peptidoglycan (WTA). La détermination des propriétés dynamiques du peptidoglycane est aussi utilisée pour étudier les interactions entre protéines et peptidoglycane et la complexation avec des ions divalents.
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Dates et versions

tel-00825098 , version 1 (22-05-2013)

Identifiants

  • HAL Id : tel-00825098 , version 1

Citer

Thomas Kern. Approches innovantes en RMN biomoléculaire: Cinétiques moléculaires par RMN rapide et paroi bactérienne par RMN du solide. Biophysique [physics.bio-ph]. Université Joseph-Fourier - Grenoble I, 2009. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00825098⟩
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