Les méduses sont des composants importants des écosystèmes marins. Leurs proliférations spectaculaires ont de graves impacts écologiques et socioéconomiques et sont apparemment renforcées par les pressions anthropiques en milieu marin. Les inquiétudes suscitées par l’accroissement de la fréquence et de l’intensité de ces proliférations, du moins dans certaines régions du globe, appellent à une compréhension plus approfondie de leurs causes. Cependant, la plupart des méduses ont un cycle de vie complexe, comprenant à la fois des stades benthiques et pélagiques, ce qui complique la compréhension des épisodes de proliférations et empêche toute prévision fiable de leur évolution. De plus, le manque de connaissances sur l’avenir de la biomasse générée par les proliférations entrave l'évaluation de leurs impacts. Pour cela, l’écosystème semi-fermé de étang de Thau présente la particularité rare d’abriter une population complète et résidente de la méduse Aurelia coerulea. Il offre donc le cadre idéal pour étudier les multiples processus écologiques qui affectent la dynamique de ses populations benthiques et pélagiques. Ce travail de thèse tire parti de cette opportunité rare afin de préciser l’origine et le devenir des proliférations d’A. coerulea. Cela a été accompli en deux étapes. Premièrement, la dynamique de la population benthique de l’espèce a été étudiée dans l’étang et complétée par une étude de l’écologie trophique des deux stades de vie sur une année. Pour ce faire, des suivis in situ ont été réalisés et complétés par l’analyse de contenus stomacaux et des comparaisons de signatures en isotopes stables. Deuxièmement, le devenir de la biomasse d’A. coerulea dans la lagune a été étudié en évaluant la prédation des poissons sur ses stades benthiques et pélagiques et en suivant la disparition de ses méduses mortes, une fois posées sur le fond. Ceci a été réalisé par analyse moléculaire du contenu des intestins de poisson et par des expériences in situ évaluant les taux de décomposition des méduses et le rôle potentiel de la faune benthiques dans leur disparition. les résultats obtenus mettent en évidence l'interaction complexe de paramètres environnementaux biotiques et abiotiques qui modulent l’intensité des proliférations en influençant conjointement les populations benthiques et pélagiques d'A. coerulea. La température, la salinité, la disponibilité en nourriture et la prédation semblent être les principaux facteurs écologiques contrôlant les proliférations de A. coerulea dans l’étang de Thau, avec quatre périodes critiques dans l’année, où la formation des proliférations est soit facilitée soit minimisée. Enfin, les blooms ont trois principaux devenirs dans la lagune. Les méduses sont avant tout consommées vivantes dans la colonne d’eau par les prédateurs pélagiques (notamment les poissons). Sinon, lorsqu’elles meurent et coulent sur le fond, elles peuvent être consommés par certains organismes benthiques (notamment des gastéropodes) mais sont surtout rapidement reminéralisés par la communauté microbienne locale. Ces résultats apportent des informations précieuses pour prédire l'évolution des proliférations de méduses en réponse aux effets anthropogéniques sur le milieu marin en cours, et anticiper leurs impacts sur le fonctionnement des écosystèmes. Cependant, ils soulignent également la difficulté d’obtenir de telles prévisions et soulignent la nécessité de mener des études approfondies similaires, non seulement pour d’autres méduses mais aussi dans d’autres régions du monde.