Activité transcriptionnelle de la protéine ribosomique uL11 - TEL - Thèses en ligne Access content directly
Theses Year : 2021

Transcriptional activity of the ribosomal protein uL11

Activité transcriptionnelle de la protéine ribosomique uL11

Abstract

In drosophila, the ribosomal protein uL11 is involved in translation and regulates transcription. Indeed, uL11 trimethylated on lysine 3 directly interacts with the enhancer of Trithorax and Polycomb Corto and co-localises with it on many sites on polytene chromosomes. Furthermore, RNA-seq analyses of larval wing imaginal discs over-expressing uL11 or the chromodomain of Corto show that many ribosomal biogenesis and ribosomal protein genes are up-regulated. Three mutants of uL11K3 were obtained by CRISPR-Cas9 (uL11K3A, uL11K3Y et uL11ΔK3). Puromycine incorporation showed that only uL11K3A has a decreased translation in agreement with its dominant Minute phenotypes (which include high lethality, longer development, shorter bristles). Co-immunoprecipitation experiments show that uL11K3A and uL11K3Y do not interact with the chromodomain of Corto. Whereas, surprisingly, uL11ΔK3 still interacted with it. RNA-seq analyses of the wing imaginal disc transcriptomes of uL11K3A and uL11K3Y show that few genes are deregulated (414 genes for the former, 84 genes for the latter). As in Saccharomyces cerevisiae, uL11 controls transcription of genes of the PHO pathway in low-phosphate conditions. We next tested whether the uL11 mutants were more affected in restrictive diet conditions. We focused on the uL11K3Y mutants which are unaffected in normal conditions. In a restrictive diet, developmental time of uL11K3Y mutants is longer than the wild-type one, and their wings are smaller. Thus, in drosophila as S. cerevisiae, the transcriptional activity of uL11 might be important in poor environmental conditions.
Chez la drosophile la protéine ribosomique uL11 est impliquée dans la traduction et régule la transcription. En effet, uL11 triméthylée sur la lysine 3 interagit avec l’Enhancer de Trithorax et Polycomb Corto et co-localise avec lui en de nombreux sites sur les chromosomes polytènes. De plus, l’analyse du transcriptome de disques imaginaux d’ailes surexprimant uL11 ou le chromodomaine de Corto (CortoCD) montre que les gènes codant des protéines importantes pour la biogenèse des ribosomes sont plus exprimés. Nous avons généré 3 mutants d’uL11K3 en utilisant la technologie CRISPR/Cas9 (uL11K3A, uL11K3Y et uL11ΔK3). Seuls les mutants uL11K3A présentent des phénotypes Minute (létalité élevée, retard de développement, soies courtes) corrélés à une diminution du taux global de traduction. Nous avons montré qu’uL11K3A et uL11K3Y n’interagissent pas avec CortoCD. Alors que de manière inattendue, uL11ΔK3 interagit avec CortoCD. L’analyse du transcriptome de disques imaginaux d’ailes uL11K3A et uL11K3Y montre que peu de gènes sont dérégulés : 414 et 84 gènes chez les mutants uL11K3A et uL11K3Y, respectivement. Chez S. cerevisiae, uL11 contrôle la transcription de gènes de la voie PHO dans un milieu pauvre en phosphates. Nous avons donc testé si un milieu nutritionnel pauvre affecterait les mutants uL11. Nous avons étudié les mutants uL11K3Y qui ne présentent pas de phénotypes en conditions normales. Dans ce milieu pauvre, ces mutants ont un développement plus court et des ailes plus petites que les individus sauvages. Ainsi, chez la drosophile comme chez S. cerevisiae, l’activité transcriptionnelle d’uL11 pourrait être importante dans des conditions environnementales défavorables.
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tel-03465133 , version 1 (03-12-2021)

Identifiers

  • HAL Id : tel-03465133 , version 1

Cite

Heloïse Grunchec. Activité transcriptionnelle de la protéine ribosomique uL11. Biologie du développement. Sorbonne Université, 2021. Français. ⟨NNT : 2021SORUS195⟩. ⟨tel-03465133⟩
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