Les lésions de la moelle épinière entrainent des déficiences multiples, dont des troubles digestifs invalidants, alliant constipation et incontinence. Ces troubles ont des conséquences à la fois physiques avec de multiples complications locorégionales et générales ; et à la fois des conséquences psychologiques avec une altération majeure de la qualité de vie à cause des troubles digestifs. Bien que les patients considèrent la prise en charge de leurs troubles digestifs comme une priorité parmi leurs autres déficiences, la physiopathologie de ces déficiences digestives est assez mal connue. La première partie de la thèse a pour but de synthétiser les déficiences multi-systèmes des blessés médullaires avec un focus sur les troubles digestifs et leur prise en charge. La seconde partie décrit le fonctionnement du SNE et de la BEI, et présente une revue de littérature sur les modifications connues de ces deux éléments après lésion médullaire. La troisième partie présente nos résultats, d’abord dans deux modèles murins de lésion médullaire permettant une approche fondamentale puis dans une étude translationnelle à partir de biopsies digestives humaines afin d’identifier les acteurs du remodelage du SNE et de la BEI. Puis une dernière étude clinique met en évidence l’intérêt d’une nouvelle technique thérapeutique, la caecostomie percutanée endoscopique, qui pourrait également devenir un moyen d’administration locorégionale de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles mises en évidence dans nos études fondamentales.