Développement de sondes peptidiques à base de complexes de lanthanides luminescents destinés à l'imagerie optique de zinc(II) intra-cellulaire - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2022

Luminescent Lanthanide-based bioprobes for zinc(II) detection for cellular imaging

Développement de sondes peptidiques à base de complexes de lanthanides luminescents destinés à l'imagerie optique de zinc(II) intra-cellulaire

Ji-Hyung Choi
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 1285911
  • IdRef : 262657627

Résumé

Deducing molecular mechanisms of biological functions in living cells requires non-invasive analytical tools that can monitor cell dynamics with high spatial and temporal resolution. In our laboratory, we aim to develop detection tools of various biomolécules such as copper(II), zinc(II) and DNA.Our bioprobes have a peptidic backbone that can recognize the target molecule with high specificity and have a lanthanide luminescent complexes suited for targeted biological imaging.Lanthanides’ unique photophysical properties make them advantageous for biological imaging by allowing time-gated luminescence microscopy at millisecond-long scale . Time-gated microscopy overcomes common problems due to background noise from the short-lifetime autofluorescence of biological samples. In cellular imaging, the auto-fluorescence can be minimized by choosing the excitation and emission wavelength in the diagnostic window which starts from 650nm to 1300 nm.Here, we present our strategy to develop a responsive bioprobe for zinc(II) in living cells by luminescence lifetime modulation based on energy exchange between the lanthanide complex and an aromatic compound taking the role of a quencher of luminescence.To convert Lanthanide luminescent complexes into zinc(II) bioprobes, they have been conjugated to a peptidic sequence mimicking zinc fingers to offer high selectivity for zinc(II) with an affinity matching the physiological concentration. The zinc finger folds into a rigid structure when coordinating a zinc ion containing two beta sheets and one alpha helix. The conformational change will modulate the distance between the lanthanide complex and the quencher and thus, it will modulate the luminescence response. In particular, we focus on lifetime response.Moreover, we design our lanthanide complexes to be compatible with two-photon (2P) absorption in order to get the excitation wavelength in the diagnostic window and reduce photo-damage to cells due to light excitationWe will describe in this thesis the synthesis of conjugatable lanthanide complexes and the spectroscopic properties of several lanthanide luminescent bioprobes synthesized in our laboratory. We will also present our effort to develop a strategy involving several cell penetrating peptides to internalize 2P-lanthanide complexes into living cells.
Nous souhaitons développer des outils de détection, de localisation et de quantification de molécules tel que le cuivre, de zinc et d’ADN. Nos sondes ont la particularité d’avoir une base peptidique et d’utiliser des complexes de lanthanides. Le peptide est la structure principale qui joue le rôle de reconnaissance spécifique de la molécule cible et le complexe de lanthanide est utilisé pour ses propriétés de luminescence particulières.Les lanthanides possèdent des émissions sur tout le spectre électromagnétique, les raies sont fines et caractéristiques à chacun des lanthanides et enfin, leurs longs temps de vie de luminescence permettent une détection en temps résolu. Ces propriétés sont avantageuses pour l’utilisation en milieu biologique car il est possible de se placer sur le domaine de transparence du milieu cellulaire et de s’affranchir de l’autofluorescence à durée de vie très courte par rapport à la luminescence des lanthanides. En contrepartie, le mauvais coefficient d’absorption des lanthanides impose l’utilisation d’une antenne dont la fonction est de « capter » l’énergie de l’excitation et de transférer l’énergie vers la lanthanide par « effet antenne ».Mon projet de thèse consiste à développer des sondes pour la détection du zinc(II) dans les cellules vivantes par microscopie. La reconnaissance du zinc(II) sera effectuée par un peptide doigt de zinc (ZF) capable de reconnaître le zinc(II) sélectivement. Le peptide a la particularité de sereplier en deux feuillets betas; et une hélice alfa; lorsque le zinc(II) est coordonné ; sans l’ion, le peptide perd sa conformation rigide. La réponse de la sonde se mesurera sur la luminescence d’un lanthanide couplé au ZF et sera modulée par la reconnaissance du zinc(II). Plus précisément, on mesurera la réponse par le temps de vie de luminescence car le temps de vie est indépendante de la concentration locale contrairement aux mesures des intensités de luminescence ; on peut donc utiliser le temps de vie pour des mesures quantitatives. De plus, l’antenne devra être compatible à l’absorption bi-photonique (2P) afin d’obtenir une longueur d’onde d’excitation et d’émission dans la fenêtre de transparence du milieu cellulaire.Dans cet optique, le principe de la sonde se fonde sur la modulation du transfert d’énergie entre le complexe de lanthanide et un désactivateur. Cette modulation est permise par une modulation de distance entre ces deux composés par le repliement du peptide ZF.Ainsi, cette thèse comportera de multiples aspects.Nous présenterons nos efforts pour développer des complexes de lanthanides luminescents conjugables à un peptide, puis le développement des sondes à zinc et ses analyses spectroscopiques ; et enfin, nous présenterons nos recherches d’une stratégie d’internalisation dans les cellules vivantes. Pour le moment, il existe peu d’exemples dans la littérature de sondes à base de complexe de lanthanide capables de s’internaliser sur cellules vivantes. La plupart utilise des cellules fixées ou ajoute des additifs perforant la membrane. Notre ouverture sur la chimie des peptides nous ont conduit à étudier des séquences peptidiques permettant la pénétration cellulaire, appelées CPP ( Cell Penetrating Peptide). Parmi les CPPs testés, un CPP s’est démarqué avec lequel nous avons obtenus des résultats prometteurs.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-04213500 , version 1 (21-09-2023)

Identifiants

  • HAL Id : tel-04213500 , version 1

Citer

Ji-Hyung Choi. Développement de sondes peptidiques à base de complexes de lanthanides luminescents destinés à l'imagerie optique de zinc(II) intra-cellulaire. Biochimie [q-bio.BM]. Université Grenoble Alpes [2020-..], 2022. Français. ⟨NNT : 2022GRALV012⟩. ⟨tel-04213500⟩
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