L'environnement façonne les communautés microbiennes qui dirigent les cycles biogéochimiques des océans, mais les facteurs biotiques sont également d’important déterminants dans la structure des communautés. Ces systèmes dynamiques sont composés d'espèces cooccurrentes structurées dans un réseau complexe d'interactions entre organismes et avec leur environnement. Les vitamines B1 et B12 sont des cofacteurs essentiels mais la plupart des microbes marins incluant de nombreuses espèces de phytoplancton, ne peuvent pas les produire eux-mêmes (auxotrophes aux vitamines). De plus, les vitamines B1 et B12 sont rares dans l’océan. Ensemble, ces observations soulèvent la question suivante : comment les auxotrophes assurent-ils leurs besoins en vitamines dans l’océan ? Cette question reste en grande partie sans réponse car la saisonnalité des auxotrophes et leur interaction avec les producteurs de vitamines restent peu étudiées. Pour combler ces lacunes, nous avons réalisé une série temporelle métagénomique mensuelle sur 7 ans dans un site côtier de Méditerranée Nord-Ouest (station SOLA) afin d'évaluer la saisonnalité à long terme des communautés procaryotes, en se focalisant sur les métabolismes des vitamines B1 et B12 et leur interaction potentielle au cours des saisons. Tout d'abord, nous avons mis en évidence une succession saisonnière de différents organismes pouvant utiliser des voies distinctes pour produire de la B12 tout au long de l'année. En été, les bactéries du genre HIMB11, UBA8309 et Puniceispirillum peuvent utiliser la voie de production aérobie, tandis qu'en hiver, les archées du genre Nitrosopumilus et Nitrosopelagicus peuvent utiliser la voie de production anaérobie. Ensuite, nous avons montré que lors de perturbations environnementales, les organismes habituellement porteurs de gènes de synthèse de la B12 sont remplacés par d'autres porteurs du même gène (redondance fonctionnelle), maintenant ainsi le potentiel de production de B12. Cette assurance écologique pourrait contribuer à la résilience fonctionnelle à long terme des communautés microbiennes marines exposées à des conditions environnementales interannuelles contrastées. Deuxièmement, nous avons montré que les communautés procaryotes à SOLA étaient dominées par des auxotrophes HMP (Pelagibacter), dont l'abondance était plus élevée en été avec d’autre auxotrophes plus rares (doubles HET/HMP, comme HIMB59), et par des auxotrophes B1 (HIMB11), qui étaient présents tout au long de l'année. À SOLA, nous avons rapporté une plus grande contribution des producteurs de B1 que précédemment observé dans d'autres régions, incluant des bactéries (Pseudothioglobus, MB11C04), des cyanobactéries (Synechococcus) et des archées (Nitrosopumilus). Les expériences de bio-essais ont montré de multiples périodes de limitation en vitamines et précurseurs dans l'eau de mer pendant les mois d'hiver. En outre, l'ajout de vitamines et de précurseurs a eu un impact significatif sur la structure de la communauté procaryote dans nos microcosmes, en particulier en Février. Différents ASV ont été sélectivement favorisés par différentes conditions pendant la transition hiver/printemps. Cependant, la réponse des communautés reste difficile à démêler sachant que les auxotrophes et les prototrophes sont impactés par l’ajout de vitamines/précurseurs. Enfin, grâce à l’assemblage de MAGs et en identifiant leurs potentiels de production pour la B1 et la B12, nous avons montré des schémas de cooccurrence forts et récurrents entre les auxotrophes et les producteurs de vitamines, reflétant différentes complémentarités fonctionnelles potentielles en fonction des saisons. La double complémentarité pour la B1 et la B12 était prédominante dans le réseau de cooccurrence d’été (un auxotrophe B1/B12 avec un prototrophe B1/B12), tandis que la simple complémentarité pour la B1 ou la B12 était prédominante dans les cooccurrences d'hiver (un auxotrophe B1/producteur de B12 avec un producteur de B1/auxotrophe B12).