La toux est un symptôme respiratoire fréquent et non spécifique chez l’enfant, habituellement présent uniquement durant une infection aigue des voies respiratoires. Cependant, certains enfants présentent une toux par excès de sensibilité se manifestant par des épisodes de toux fréquents ou récurrents, en dehors d’une infection, et des facteurs déclenchants habituellement non tussigènes. Bien qu’un des mécanismes étiologiques de cette hypersensibilité soit l’atopie, très peu d’études se sont intéressées à la relation entre trajectoires de toux dans l’enfance et maladies allergiques ainsi qu’à leur association avec l’environnement précoce.Afin d’identifier les trajectoires de toux dans l’enfance, d’analyser leur relation avec les maladies allergiques et avec l’environnement précoce, le travail de cette thèse a porté sur deux volets complémentaires : un volet épidémiologique observationnel chez l’enfant et un volet expérimental chez le lapin. Le volet épidémiologique reposait sur l’analyse des données de la cohorte prospective européenne PASTURE (Protection against Allergy: STUdy in Rural Environment). Parmi les 961 enfants inclus dans l’étude épidémiologique, une analyse en classes latentes a permis d’identifier cinq trajectoires de toux en dehors d’une infection : peu ou pas de symptômes (59,9 %), transitoire aigue (24,1 %), transitoire modérée (6,8 %), persistante à début tardif (4,8 %), et persistante à début précoce (4,4 %). En comparaison avec la trajectoire peu ou pas de symptômes, les autres trajectoires étaient significativement associées avec les sibilants, l’asthme et la rhinite allergique. La trajectoire persistante à début précoce avait la plus forte association pour l’asthme et était inversement associée à l’environnement fermier. L’allergie alimentaire était associée aux deux trajectoires persistantes. La sensibilisation atopique était associée uniquement à la toux persistante à début tardif. La consommation de lait de ferme bouilli durant la première année de vie était la seule exposition spécifique à l’environnement fermier significativement associée à une diminution du risque de toux persistante à début précoce et de toux transitoire aigue. Des infections respiratoires répétées ou prolongées dans la première année de vie étaient significativement associées à un risque plus élevé de toux persistante à début précoce. Le volet expérimental a permis d’évaluer l’impact de l’exposition périnatale à la poussière de ferme sur la sensibilité tussigène et la réactivité bronchique chez un modèle de lapin d’inflammation bronchique d’origine allergique. Un environnement spécifique a été appliqué aux lapines gestantes et à leurs lapereaux jusqu’à la sixième semaine de vie (zone exempte d’agent pathogène pour le groupe contrôle ; étable de veaux pour le groupe ferme). Les lapereaux étaient ensuite hébergés dans une zone conventionnelle de l’animalerie et sensibilisés à l’ovalbumine par voie intrapéritonéale. La sensibilité à la toux a été évaluée par la stimulation mécanique de la toux et la réactivité bronchique par un test à la méthacholine. Nous n’avons pas retrouvé d’effet de l’exposition précoce à une étable de veaux sur la sensibilité tussigène ni la réactivité bronchique.Nos résultats suggèrent un lien étroit entre toux persistante et pathologies atopiques ainsi que l’existence de potentiels facteurs de prévention communs. Les enfants présentant une toux persistante ou récurrente devraient être orientés vers un médecin allergologue pour qu’une évaluation allergologique complète soit réalisée. Les études de prévention des pathologies atopiques devraient également s’intéresser aux symptômes de toux en dehors d’une infection afin d’évaluer la pertinence de développer des stratégies de prévention communes.