Phenotypic and molecular characterization of different clonal complexes of Staphylococcus lugdunensis
Caractérisation phénotypique et moléculaire de différents complexes clonaux de Staphylococcus lugdunensis
Résumé
Our work initially focused to explain the worldwide predominance of Staphylococcus lugdunensis belonging to the clonal complex 1 and 3 (CC1 and CC3) strains in the healthcare setting by a possible resistance to antiseptics. We studied the susceptibility of 49 strains representative of the seven CCs described to date, to chlorhexidine digluconate (CHX) and benzalkonium chloride (BAC), frequently used in hospitals, by (i) determining MIC (Minimum Inhibitory Concentration) and MBC (Minimum Bactericidal Concentration) in microdilution and (ii) searching for the resistance genes qac and norA encoding efflux pumps. S. lugdunensis was found to be highly sensitive to both antiseptics. However, our study identified two CC3 strains with reduced susceptibility to CHX and BAC and carrying the qacA gene, one of which was resistant to meticillin.We also explored the ability of our collection of 49 S. lugdunensis strains to form biofilm, a major virulence factor that may also contribute to the spread of S. lugdunensis in healthcare settings. We demonstrated that biofilm formation in rich and iron-restricted conditions depended on phylogenetic lineage. Characterization of the biofilm matrix of two strains (from CC3 and CC6) by inhibition assays and confocal microscopy (CLSM) revealed a strain- and medium-dependent composition. Analysis of the matrix proteome of these two strains by mass spectrometry identified 322 proteins. These proteins were predominantly intracellular, and particularly involved in carbohydrate metabolism.
Nos travaux ont dans un premier temps cherché à expliquer la prédominance mondiale des souches de complexes clonaux 1 et 3 (CC1 et CC3) de Staphylococcus lugdunensis en milieu hospitalier par une éventuelle résistance aux antiseptiques. Nous avons étudié la sensibilité de 49 souches représentatives des sept CCs décrits à ce jour au digluconate de chlorhexidine (CHX) et au chlorure de benzalkonium (BAC), fréquemment utilisés en milieu hospitalier, par (i) détermination de la CMI (Concentration Minimale Inhibitrice) et de la CMB (Concentration Minimale Bactéricide) en microdilution et (ii) recherche des gènes de résistance qac et norA codant des pompes d’efflux. S. lugdunensis s’est révélé être très sensible à ces deux antiseptiques. Cependant, notre étude a identifié deux souches de CC3 de sensibilité diminuée au CHX et au BAC et comportant le gène qacA, dont une résistante à la méticilline.D’autre part, nous avons exploré la capacité de notre collection de 49 souches de S. lugdunensis à former du biofilm, facteur de virulence majeur pouvant également contribuer à favoriser l’implantation de S. lugdunensis en milieu hospitalier. Nous avons mis en évidence que la formation de biofilm en milieu riche et en milieu carencé en fer dépendait de la lignée phylogénétique. La caractérisation de la matrice du biofilm de deux souches (de CC3 et CC6) par des tests d’inhibition et en microscopie confocale (CLSM) a révélé une composition souche- et milieu-dépendante. L’analyse du protéome de la matrice de ces deux souches par spectrométrie de masse a permis d’identifier 322 protéines. Ces protéines étaient majoritairement intracellulaires, et notamment impliquées dans le métabolisme glucidique.
| Origine | Version validée par le jury (STAR) |
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