Ecological analysis of cholera hot spots in Africa
Analyse écologique des points chauds de choléra en Afrique.
Résumé
Cholera is a severe acute diarrhoeal disease caused by Vibrio cholerae, a gram-negative bacterium that colonises warm, saline, alkaline surface waters, often in association with phytoplankton or zooplankton. After 50 years of introduction of cholera in Africa, the disease is affecting African countries in a very strong way. The objective of the PhD work was to try to elucidate the causes of cholera endemicity in Africa and on the scale of a rift sector, Lake Kivu and the Katana health zone, located in the Democratic Republic of Congo.A map of geographical areas at risk was drawn up for the African continent, showing a greater number in the Rift Valley and around the Lake Chad basin. This first study highlighted the relationship between the existence of salt water bodies (lagoons, lakes, rivers) and the endemicity of the disease. Under these environmental conditions, the cholera risk is exacerbated in economically weak and unstable countries. In continental Africa, the study showed a good overlap between areas of high volcano-tectonic activity (African Rift Valley, Lake Chad basin) and cholera endemicity. The study of cholera dynamics in a Rift Valley health zone (Katana province in DRC) demonstrated that volcanic activity plays a major role in the occurrence and maintenance of cholera epidemics in the African Rift Valley. The work showed that volcano-tectonic activity (measured by the SO2 concentration in the smoke plume of the Nyiragongo volcano) governed the temperature and salinity of the waters of Lake Kivu, and the presence of the bacillus in the lake water and fish. The study was able to show that the environmental presence of the bacillus in the lake was very strongly linked to the epidemiological data of the Katana area. A study of the practices of the inhabitants of Bukavu showed that individual contamination with cholera is linked to the handling and consumption of lake products (water or fish).This doctoral work has made it possible to target areas at risk of cholera in Africa, and the impact of volcanic activity in the dynamics of cholera in continental Africa. This information is necessary to build effective and targeted strategies to fight cholera in the African continent in accordance with the global roadmap developed by the Global Task Force on Cholera Control in 2017.
Le choléra est une maladie diarrhéique aigue sévère causée par Vibrio cholerae, bactérie Gram négatif qui colonise les eaux de surface, chaudes, salines, alcalines, souvent en association avec le phyto ou le zooplancton. Après 50 ans d’introduction du choléra en Afrique, la maladie affecte de manière très forte les pays d'Afrique. Le travail de doctorat a eu pour objectif de tenter d’élucider les causes de l’endémicité du choléra en Afrique et à l’échelle d’un secteur du rift, le lac Kivu et la zone de santé de Katana, située en république démocratique du Congo.Une carte des espaces géographiques à risque a été élaborée pour le continent africain qui montre un plus grand nombre au niveau de la vallée du Rift et autour du bassin du lac Tchad. Cette première étude a mis en évidence la relation entre l’existence de masses d’eau salées (lagunes, lacs, cours d’eau) et l’endémicité de la maladie. Dans ces conditions environnementales, le risque cholérique est exacerbé dans les pays économiquement faibles, et instables. En Afrique continentale, l’étude a permis de montrer une bonne superposition entre les secteurs de forte activité volcano-tectonique (Vallée du Rift Africain, bassin du lac Tchad) et l’endémicité du choléra. L’étude de la dynamique du choléra dans une zone de santé de la vallée du Rift (province de Katana en RDC) a démontré que l'activité volcanique joue un grand rôle dans la survenue et le maintien des épidémies de choléra dans la vallée du Rift Africain. Ainsi, le travail a pu démontrer que l’activité volcano-tectonique (mesurée par la concentration en SO2 du panache de fumée du volcan Nyiragongo) régissait la température et la salinité des eaux du lac Kivu, et la présence du bacille dans l’eau du lac et les poissons. L’étude a pu montrer que la présence environnementale du bacille dans le lac était très fortement liée aux données épidémiologiques de la zone de Katana. Une étude portant sur les pratiques des habitants de Bukavu a pu démontrer que la contamination individuelle au choléra est liée à la manipulation et consommation des produits du lac (eau ou poissons).Ce travail de doctorat a permis de cibler des espaces à risque de choléra en Afrique, et l’impact de l’activité volcanique dans la dynamique du choléra en Afrique continentale, Ces informations sont nécessaires pour bâtir des stratégies efficaces et ciblés de lutte contre le choléra dans le continent Africain conformément à la feuille de route mondiale élaboré par le groupe de travail mondial sur la lutte contre le choléra en 2017.
| Origine | Version validée par le jury (STAR) |
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