Génomique de la résistance aux insecticides chez la punaise de lit Cimex lectularius - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2023

Genomic of insecticide resistance in the common bed bug Cimex lectularius

Génomique de la résistance aux insecticides chez la punaise de lit Cimex lectularius

Résumé

A strong resurgence of the common bed bug, Cimex lectularius, is observed on a global scale. The evolution of resistance to insecticides is one of the phenomena explaining this resurgence, and in particular concerning insecticides of the pyrethroid family, the most commonly used to control this hematophagous insect. One of the challenges for controlling this insect pest is to identify the genomic regions involved in this resistance. Hence, we performed a genetic differentiation analysis (population genomics) between two insecticide-resistant and two insecticide-susceptible populations of bed bugs. These analyses highlighted a superlocus containing numerous genes known to be involved in insecticide resistance in other insects. This superlocus contains many SNPs that are highly differentiated according to the resistance status of the strains, but also potential tandem duplications and inversions. In a second step, we performed a gene expression study of the bed bug, in order to detect genes differentially expressed according to the resistance phenotype and exposure to a pyrethroid. While a large number of genes were overexpressed following insecticide treatment, a much smaller number were detected as constitutively differentially regulated between resistant and susceptible strains. Finally, a high mortality rate affected our bedbug rearing, hindering the realisation of the initial project. Through metagenomic DNA and cDNA sequencing approaches, we searched for bacteria and viruses potentially responsible for this mortality, with the objective of facilitating future studies of this model, and detecting a potential pathogen of this insect.
Une forte résurgence de la punaise de lit, Cimex lectularius, est observée à l'échelle globale. L’évolution de la résistance aux insecticides est un des phénomènes expliquant cette résurgence, et en particulier concernant les insecticides de la famille des pyréthrinoïdes, la plus utilisée pour lutter contre cet insecte hématophage. Un des enjeux du contrôle de cet insecte nuisible consiste à identifier les régions génomiques impliquées dans cette résistance. Pour cela, nous avons effectué une analyse de différenciation génétique (génomique des populations) entre deux populations de punaises résistantes et deux populations sensibles aux insecticides. Ces données ont mis en évidence un superlocus contenant de nombreux gènes connus pour être impliqués dans la résistance aux insecticides chez d'autres insectes. Ce superlocus contient de nombreux SNPs fortement différenciés en fonction du statut de résistance des souches, mais également de potentielles duplications en tandem et inversions. Dans un second temps, nous avons réalisé une étude de l’expression des gènes de la punaise de lit, afin de détecter les gènes différentiellement exprimés en fonction du phénotype de résistance et de l'exposition à un pyréthrinoïde. Si un grand nombre de gènes étaient sur-exprimés suite au traitement insecticide, un nombre bien plus restreint a été détecté comme étant régulés différentiellement de manière constitutive entre les souches résistantes et sensibles. Enfin, une forte mortalité a affecté notre élevage de punaises, entravant la réalisation du projet initial. A travers des approches de séquençages d'ADN et de cDNA métagénomiques, nous avons recherché les bactéries et virus potentiellement à l’origine de cette mortalité, dans l’objectif de faciliter les études futures de ce modèle, et de détecter un potentiel pathogène de cet insecte.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-04560765 , version 1 (26-04-2024)

Identifiants

  • HAL Id : tel-04560765 , version 1

Citer

Chloé Haberkorn. Génomique de la résistance aux insecticides chez la punaise de lit Cimex lectularius. Génomique, Transcriptomique et Protéomique [q-bio.GN]. Université Claude Bernard - Lyon I, 2023. Français. ⟨NNT : 2023LYO10046⟩. ⟨tel-04560765⟩
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