Molecular and Morphological Systematics of Phyllostomid Bats : Insights from complete mitochondrial genomes
Systématique moléculaire et morphologique des chauves-souris Phyllostomidae : aperçus à partir des génomes mitochondriaux complets
Résumé
This thesis explores the molecular and morphological systematics of Phyllostomid bats, utilizing complete mitochondrial genomes to illuminate the evolutionary relationships, taxonomic status, and cryptic speciation within this diverse family. In the first chapter, I present a revised phylogeny of Phyllostomidae based on complete mitochondrial genomes from 26 species, 23 of which are newly sequenced for this study. Through meticulous analysis, I achieved a robust evolutionary framework that clarifies previously uncertain relationships among subfamilies, notably those of Lonchorhininae and Macrotinae. This work sets the stage for a more accurate classification within the family. The second chapter focuses on the genus Trachops, reassessing its taxonomic status through an integrated approach that combines morphological, morphometric, and molecular data. Our findings suggest the elevation of T. cirrhosus ehrhardti to species status, recognizing its genetic and morphological distinctiveness in southeastern Brazil. Additionally, I find no support for maintaining T. c. coffini as a distinct subspecies. The genus Trachops would then consist of two monotypic species, T. cirrohosus, and T. ehrhardti. Chapter three investigates the biodiversity and potential cryptic speciation within the genera Phylloderma and Macrophyllum, with a particular emphasis on revealing a new cryptic species from Central America. Our comprehensive analyses indicate the presence of two highly supported clades within both Phylloderma stenops and Macrophyllum macrophyllum, leading to the proposal of elevating the North Central American population of Phylloderma, P. s. septentrionalis, to species status, and the introduction of Macrophyllum sp. nov., a new species endemic to the region. This thesis underscores the complexity of Phyllostomid bat diversity and the critical role of integrated molecular and morphological analyses in uncovering hidden diversity. This contribution provides a clearer understanding of speciation processes in tropical bats, emphasizing the importance of accurate taxonomic classification for effective conservation strategies.
Cette thèse explore la systématique moléculaire et morphologique des chauves-souris Phyllostomidées, utilisant des génomes mitochondriaux complets pour éclairer les relations évolutives, le statut taxonomique et la spéciation cryptique au sein de cette famille diverse. Dans le premier chapitre, je présente une phylogénie révisée des Phyllostomidae basée sur des génomes mitochondriaux complets de 26 espèces, dont 23 ont été nouvellement séquencées pour cette étude. Grâce à une analyse minutieuse, j'ai établi un cadre évolutif robuste qui clarifie les relations auparavant incertaines parmi les sous-familles, notamment celles des Lonchorhininae et des Macrotinae. Ce travail pose les bases pour une classification plus précise au sein de la famille. Le deuxième chapitre se concentre sur le genre Trachops, réévaluant son statut taxonomique à travers une approche intégrée combinant des données morphologiques, morphométriques et moléculaires. Nos découvertes suggèrent l'élévation de T. cirrhosus ehrhardti au rang d'espèce, reconnaissant sa distinction génétique et morphologique dans le sud-est du Brésil. En plus, je ne trouve aucun soutien pour maintenir T. c. coffini comme une sous-espèce distincte. Le genre Trachops comprendrait alors deux espèces monotypiques, T. cirrohosus et T. ehrhardti. Le troisième chapitre enquête sur la biodiversité et la spéciation cryptique potentielle au sein des genres Phylloderma et Macrophyllum, avec un accent particulier sur la révélation d'une nouvelle espèce cryptique d'Amérique centrale. Les analyses complètes indiquent la présence de deux clades fortement soutenus au sein de Phylloderma stenops et Macrophyllum macrophyllum, menant à la proposition d'élever la population d'Amérique centrale du Nord de Phylloderma, P. s. septentrionalis, au rang d'espèce, et l'introduction de Macrophyllum sp. nov., une nouvelle espèce endémique de la région. Cette thèse souligne la complexité de la diversité des chauves-souris Phyllostomidées et le rôle crucial des analyses moléculaires et morphologiques intégrées pour découvrir la diversité cachée. Cette contribution fournit une compréhension plus claire des processus de spéciation chez les chauves-souris tropicales, soulignant l'importance d'une classification taxonomique précise pour des stratégies de conservation efficaces.
| Origine | Version validée par le jury (STAR) |
|---|