Thèse Année : 2024

Amebiasis in Lebanon : Prevalence, genetic susceptibility, and correlation of Entamoeba histolytica with water quality

L'amibiase au Liban : prévalence, susceptibilité génétique, et corrélation d'Entamoeba histolytica avec la qualité de l'eau

Résumé

Entamoeba is a genus of parasitic protozoa that includes Entamoeba histolytica (E. histolytica), known for causing amebiasis in humans. In South Lebanon, high rates of amebiasis among infants and children imply the presence of E. histolytica in water sources. Contaminated tap water, used for hygiene, poses a risk, particularly since this parasite can persist in water for months, influenced by environmental conditions. Our study was undertaken in Nabatieh and Hasbayya districts to evaluate domestic water quality regarding parasitic contamination and to correlate water quality variables with parasitic presence, while improving detection methods.In this research, 90 drinking water samples and 15 surface water samples were analyzed for various parameters, including physical, chemical, and microbiological qualities. The contamination by Entamoeba spp. was assessed using microscopy and a new spectrophotometric method. Notably, significant contamination levels of phosphates, coliforms, and Entamoeba spp. were found in Nabatieh's domestic water. Additionally, contamination in the Hasbani river and domestic water in Hasbayya was confirmed, particularly with total and fecal coliforms and Entamoeba spp. cysts, posing health risks to children in the region. A weak correlation between cysts and total coliforms suggested possible groundwater contamination by soil.Further, an epidemiological study with 180 children revealed a 25% prevalence of amebiasis, connecting consumption of contaminated water and agricultural practices near homes to increased risk. Despite these findings, community awareness regarding E. histolytica remains low.Potentially, high prevalence rates may be overestimated due to analytical inaccuracies or genetic predisposition among local children. Traditional microscopy is insufficient for species differentiation and may produce false positives; therefore, molecular diagnostics are pivotal for accurate disease understanding in the region.Collected stool samples from diagnosed children were re-analyzed with species-specific PCR, confirming the molecular prevalence of amebiasis. A case-control genetic association study also encompassed 180 participants, assessing the TLR2 rs3804099 polymorphism related to amebiasis susceptibility. Results indicated a strong association between this genetic variant and increased disease risk, underlining the influence of genotype-phenotype correlations on infectious disease susceptibility in endemic areas. This study emphasizes the critical role of water quality in health and highlights the necessity for advanced diagnostic methods in accurately assessing the prevalence of E. histolytica.

Entamoeba est un genre de protozoaires parasites, dont l'espèce la plus connue, Entamoeba histolytica, cause l'amibiase chez les humains. Au sud du Liban, une forte prévalence de l'amibiase chez les jeunes enfants indique la présence de ce pathogène d'origine hydrique dans les sources d'eau locales. L'eau du robinet contaminée, utilisée pour l'hygiène corporelle, peut être ingérée par les enfants. Étant donné que ce parasite peut survivre dans l'eau pendant plusieurs mois selon la température, la qualité de l'eau est cruciale pour la santé publique. Les objectifs de cette étude étaient d'évaluer la qualité de l'eau domestique, d'examiner la corrélation entre contamination parasitaire et variables de qualité de l'eau, et d'améliorer les méthodes de détection.Nos études ont été menées dans les districts de Nabatiyeh et Hasbayya, en tenant compte des différences environnementales entre villes et villages. Au total, 90 échantillons d'eau potable et 15 d'eau de surface ont été analysés pour leurs paramètres physiques, chimiques et bactériologiques. La contamination par Entamoeba spp. a été examinée par microscopie, tandis qu'une analyse spectrophotométrique a été effectuée pour identifier des pics communs parmi les échantillons positifs. Pour la première fois, la contamination de l'eau domestique à Nabatiyeh par des phosphates, des coliformes totaux et fécaux, ainsi que par des kystes d'Entamoeba spp. a été confirmée. À Hasbayya, des contaminants microbiologiques similaires ont été trouvés dans l'eau de la rivière Hasbani et dans l'eau domestique, indiquant un risque pour la santé des enfants.Une faible corrélation a été observée entre les kystes et les coliformes totaux, suggérant une contamination potentielle des réseaux d'eau souterrains par le sol. Parallèlement, une méthode simple et économique a été développée pour mesurer la concentration de kystes d'Entamoeba spp., ce qui pourrait faciliter la recherche.Pour mieux comprendre la prévalence et les risques environnementaux associés à l'amibiase à Nabatiyeh, une étude épidémiologique impliquant 180 enfants a été réalisée. Les résultats ont révélé une prévalence de 25% d'amibiase, avec des facteurs de risque liés à la consommation d'eau contaminée et aux activités agricoles à proximité des logements. La sensibilisation insuffisante de la population concernant E. histolytica a également été mise en lumière.Il convient de noter que la forte prévalence de l'amibiase pourrait également être liée à des erreurs analytiques et à une prédisposition génétique. La microscopie optique, largement utilisée dans les centres médicaux, peut conduire à des faux positifs, tandis que le diagnostic moléculaire serait plus spécifique. Les variations génétiques des gènes de réponse immunitaire, notamment les récepteurs TLR, peuvent jouer un rôle dans cette dynamique.Dans le cadre de l'étude, 40 échantillons de selles ont été collectés des enfants diagnostiqués avec une infection à E. histolytica et analysés par PCR. Une étude de cas-témoins, comprenant 180 participants, a exploré le polymorphisme rs3804099 du gène TLR2. Les résultats indiquent une forte prévalence d'amibiase et une association entre le polymorphisme et un risque accru chez les enfants Libanais, soulignant l'importance de méthodes de diagnostic plus précises et la nécessité de comprendre les implications des facteurs génétiques sur la santé des enfants dans les régions touchées.

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Israa Dib. L'amibiase au Liban : prévalence, susceptibilité génétique, et corrélation d'Entamoeba histolytica avec la qualité de l'eau. Sciences agricoles. Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12, 2024. Français. ⟨NNT : 2024PA120060⟩. ⟨tel-05226632⟩
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