Predictive models for kinetic and thermodynamic parameters of reactions - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2018

Predictive models for kinetic and thermodynamic parameters of reactions

Modèles prédictifs pour les paramètres cinétiques et thermodynamiques des réactions chimiques

Résumé

This work is devoted to QSPR modeling of kinetic and thermodynamic properties of chemical reactions using the Condensed Graph of Reaction (CGR) approach. CGR allows encoding structures of reactants and products into one sole molecular graph for which molecular descriptors can be generated. A comprehensive database containing some 11000 manually collected reactions has been developed then used in the modeling. Predictive models were built for rate constants of Diels-Alder, SN2 and E2 reaction as well as for equilibrium constants of tautomeric transformations. They are available for the users via WEB portal. A part of the thesis concerned quantum mechanics studies of reactions between sydnones and strained alkynes for which the size of the dataset was not sufficient to produce statistically meaningful models.
Ce travail est consacré à la modélisation QSPR des propriétés cinétiques et thermodynamiques des réactions chimiques à l'aide de l'approche Graphe Condensé de Réaction (CGR). Le CGR permet de coder des structures de réactifs et de produits en un seul graphe moléculaire pour lequel des descripteurs moléculaires peuvent être générés.Une base de données contenant plus de 11000 réactions collectées manuellement a été développée puis utilisée dans la modélisation. Les modèles prédictifs ont été construits pour les constantes de vitesse de réactions Diels-Alder, SN2 et E2 ainsi que pour les constantes d'équilibre des transformations tautomères. Ils sont rendus publics via un portail WEB. Une partie de la thèse concerne une étude de mécanique quantique des réactions entre des sydnones et des alcynes contraints pour lesquels la taille du jeux de données n'était pas suffisante pour produire des modèles statistiquement significatifs.
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Origine Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-01943764 , version 1 (04-12-2018)

Identifiants

  • HAL Id : tel-01943764 , version 1

Citer

Timur Gimadiev. Predictive models for kinetic and thermodynamic parameters of reactions. Cheminformatics. Université de Strasbourg; Kazanskij gosudarstvennyj universitet im. V. I. Ulʹânova (Kazanʹ), 2018. English. ⟨NNT : 2018STRAF007⟩. ⟨tel-01943764⟩
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