Réseaux neuronaux convolutifs profonds et représentations hiérarchiques : applications et perspectives pour la pathologie numérique - TEL - Thèses en ligne Accéder directement au contenu
Thèse Année : 2020

Deep convolutional neural networks and hierarchical representations : applications and perspectives for digital pathology

Réseaux neuronaux convolutifs profonds et représentations hiérarchiques : applications et perspectives pour la pathologie numérique

Résumé

Deep convolutional neural networks excel at solving recognition problems in images. Recent advances in the field of digitisation of histological slides now make it possible to use these algorithms in real biomedical applications in microscopy. Automatic analysis solutions are therefore naturally developed to reduce diagnostic errors. We present two applications, one for the analysis of immunohistochemical markers, the other to assist in the diagnosis of lymphomas. Finally, we present the limits of deep learning to solve biomedical problems. This critique leads us to rethink deep learning as a support for data mining tools. By means of segmentation trees or subsumptions, these techniques, supported by deep learning, are compatible with human interpretation, economical in annotation and learning.
Les réseaux neuronaux convolutifs profonds excellent à résoudre les problèmes de reconnaissance dans les images. Les avancées récentes dans le domaine de la numérisation des lames histologiques permettent aujourd’hui d’utiliser ces algorithmes dans de véritables applications biomédicales en microscopie. Des solutions d’analyse automatiques sont donc naturellement développées pour réduire les erreurs de diagnostic. Nous présentons deux applications, l’une pour l’analyse de marquages immunohistochimiques, l’autre pour assister le diagnostic des lymphomes. Nous présentons enfin les limites de l’apprentissage profond pour résoudre les problématiques biomédicales. Cette critique conduit à repenser l’apprentissage profond comme un soutien aux outils de fouille de données. Par le biais d’arbres de segmentations ou de subsomptions, ces techniques, soutenues par l’apprentissage profond, sont compatibles avec l’interprétation humaine, économes en annotation et en apprentissage.
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Origine : Version validée par le jury (STAR)

Dates et versions

tel-03855944 , version 1 (16-11-2022)

Identifiants

  • HAL Id : tel-03855944 , version 1

Citer

Arnaud Abreu. Réseaux neuronaux convolutifs profonds et représentations hiérarchiques : applications et perspectives pour la pathologie numérique. Bio-informatique [q-bio.QM]. Université de Strasbourg, 2020. Français. ⟨NNT : 2020STRAD026⟩. ⟨tel-03855944⟩
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