Les premiers stades de la formation des étoiles s'accompagnent de puissantes éjections de masse sous forme de jets hypersoniques et d'écoulements bipolaires, qui interagissent avec leur enveloppe parentale par le biais de chocs. Ainsi, ces chocs injectent de la masse et de l'énergie, modifiant les propriétés du matériau protostellaire qui alimente l'étoile naissante. De plus en plus de preuves montrent qu'ils modifient fortement la complexité moléculaire du gaz protostellaire, alors qu'ils peuvent servir à sonder la composition chimique du gaz moléculaire et de la poussière pendant la phase pré-stellaire. Ainsi, l'objectif principal de cette thèse était de contraindre les processus physiques et chimiques générés dans et par la région d'éjection protostellaire. Pour ce faire, j'ai réalisé une étude approfondie de la composition chimique des chocs d'éjection associés au système protostellaire Cep E. Cet objet est un système binaire de classe 0 isolé, de masse intermédiaire, possédant une géométrie 3D bien caractérisée et un flot bipolaire brillant.Mon travail était basé sur l'analyse et la modélisation d'un large jeu de données obtenu avec l'interféromètre IRAM/NOEMA, dans le cadre du Grand Programme SOLIS, avec une résolution angulaire de 0.5’’ à 1.3mm et 2’’ à 3mm, respectivement. J'ai également analysé les données du projet W14AF avec une résolution angulaire de 1.5’’ à 1.3mm et 2.5’’ à 3mm. Dans un premier temps, une recherche systématique de molécules dans le jet a été effectuée et grâce à la haute qualité des données spectrales, j'ai pu détecter 15 transitions moléculaires de SiO, SO, HCN, HCO+, CS, H2CO et CH3OH (pour la première fois) dans le jet de Cep E. La présence de matières organiques dans les jets n'est pas seulement rare mais reste déroutante, en effet elle soulève plusieurs questions sur l'interaction des chocs avec l'enveloppe protostellaire ainsi que sur le mécanisme à l'origine de ces chocs, à savoir le jet protostellaire lui-même, et les phénomènes de perte de masse.Par conséquent, mon premier travail Schutzer et al. (2022) a été consacré à la construction d'un scénario cinétique pour le jet de Cep E, avec les données de résolution angulaire les plus élevées. J'ai identifié deux composants dans le jet : un interne, étroit et collimaté ; et une couche de gaz externe plus large. Le jet montre des preuves de la variabilité de l'éjection de masse, tracée par les nombreux chocs internes détectés (18) le long des lobes à grande vitesse. En outre, une échelle de temps dynamique de 55 ans entre les éjections ultérieures à proximité de la protoétoile avec une variabilité de vitesse qui pourrait permettre des collisions de nœuds. De même, nous avons observé qu'une partie du matériau de l'enveloppe est entraînée par le jet à grande vitesse et écartée.Après avoir caractérisé la cinétique du jet Cep E, nous nous sommes attaqués à l'origine de la riche chimie de cette région. Le lobe nord est plus riche que le sud. Nous avons proposé que cette différenciation chimique soit due au fait que la matière entraînée (gaz et poussière) est entraînée par le jet, puis la matière gelée sur les manteaux de poussière (CH3OH), est libérée en raison des chocs internes dans le jet à plus distants par rapport à la protoétoile, en plus du fait que le jet frappe les parois de la cavité riches en produits chimiques.Enfin, en collaboration avec le Dr P. Rivera-Ortiz, nous avons utilisé le code chimio-HD WALKYMIA pour modéliser la formation et reproduire les propriétés de l'émission de CO dans Cep E flot. La comparaison entre le modèle et de les observations nous a permis de reproduire avec un accord très satisfaisant~: la morphologie et les propriétés de l'écoulement (masse et taille), le taux de perte de masse et l'historique 3D des événements de perte de masse qui a façonné le système Cep E. De plus, nous avons pu contraindre les conditions du processus d'éjection et déterminer l'interaction du jet avec l'enveloppe parentale.